Como parte de su estrategia de trabajo, COMISEDH forma parte de diversas redes interinstitucionales y mesas de trabajo regional y nacional de organizaciones de la sociedad civil y algunas con presencia de entidades del Estado.
COMISEDH es miembro fundador de la Coordinadora Nacional de Derechos Humanos (CNDDHH) y es actual miembro de su Consejo Directivo Nacional. La CNDDHH agrupa a 67 organismos de derechos humanos que trabajan en todo el territorio nacional y cuenta con un amplio reconocimiento internacional.
A nivel regional de Ayacucho: