Este programa surge como consecuencia de las reformas institucionales, como garantías de no repetición, propuestas por la CVR. Tiene que ver esencialmente con la capacitación y formación en derechos humanos de agentes de seguridad (PNP, INPE y FFAA -en su función de seguridad-), con el impulso a reformas normativas y el establecimiento de políticas acordes a los instrumentos internacionales de derechos humanos en estas instituciones.

De otro lado, tiene que ver con reformas de la legislación penal y el establecimiento de instituciones de prevención acordes con los instrumentos internacionales suscritos por el Perú. Finalmente desarrolla un esfuerzo inicial en materia de educación escolarizada en zonas rurales con miras a desarrollar una propuesta de mayor envergadura en el futuro.

Las líneas de este programa son las siguientes:

1. Adecuación de la legislación penal al Estatuto de Roma de la Corte Penal Internacional y otras normas internacionales;
   
   
2. Acciones para el establecimiento de un Mecanismo Nacional de Prevención de la tortura, de acuerdo al Protocolo Facultativo de la Convención contra la Tortura
   
   
3. Módulo de educación en derechos humanos para profesores rurales;
   
   
4. Normas de derechos humanos para las fuerzas estatales de seguridad. Se ha participado en la formulación del Manual de derechos humanos aplicado a la función penitenciaria.
   
   
5. Capacitación y formación en derechos humanos de agentes estatales de seguridad: Policía Nacional (en coordinación con la Secretaría Permanente de la Comisión Nacional de Derechos Humanos del Ministerio del Interior), INPE, FFAA (a través del Centro de Derecho Internacional Humanitario y Derechos Humanos de las Fuerzas Armadas) y Ejército Peruano (a través de la Dirección de Asuntos Civiles del EP)